Prodi Akuakultur mengkaji tentang IPTEK bidang Budidaya Ikan lokal dengan fokus kajian Pemuliaan, Nutrisi, Kesehatan Ikan, Lingkungan serta Sistem & Teknologi Akuakultur. Dosen/Tenaga Pengajar berjumlah 17 orang berasal dari lulusan Kampus Ternama Dalam dan Luar Negeri. Program Studi Akuakultur saat ini telah Terakreditasi B berdasarkan Keputusan BAN-PT No. 457/SK/BAN-PT/Akred/S/III/2019 terhitung mulai 19 Maret 2019 hingga 19 Maret 2024.